Antonio Hernández Daranas es químico de estructuras con intereses en la biología estructural. Entre sus contribuciones figuran la publicación de un procedimiento experimental para utilizar la calorimetría isoterma de titulación como técnica válida para el estudio de sistemas de baja afinidad de importancia biológica y sintética y el uso de constantes de acoplamiento homo y heteronucleares de Resonancia Magnética Nuclear (RMN) junto con cálculos de Mecánica Cuántica para desarrollar metodologías mejoradas para la determinación estructural de moléculas pequeñas. Las aplicaciones a lo largo de los años se centraron en el estudio químico de los organismos marinos, en particular los dinoflagelados, que dio como resultado el descubrimiento y la elucidación de la estructura de varios productos naturales bioactivos novedosos. El estudio de las interacciones entre proteínas y ligandos mediante resonancia magnética nuclear, calorimetría y simulaciones computacionales ha sido otro importante tema de investigación. En los últimos años, uno de los principales objetivos de su trabajo ha sido el desarrollo de metodologías más eficaces para la elucidación de estructuras mediante técnicas computacionales y espectroscopia de RMN.