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CTM2016-80095-C2-2-R. Nuevas aproximaciones para la exploración de las interacciones microbianas en comunidades marinas (NOVAMAR)

Los océanos constituyen el ecosistema más grande de la Tierra a la vez que es uno de los más desconocidos. Las actividades de los microorganismos marinos regulan los ciclos biogeoquímicos y ejercen una gran influencia en el control de clima. La población humana tiene un fuerte impacto sobre los océanos y, al contrario, depende en gran medida de sus recursos. En proyectos anteriores hemos hecho uso de las nuevas tecnologías de secuenciación para describir las comunidades del bacterioplancton. Nos hemos centrado en los Bacteroidetes debido a que suponen una parte importante de las comunidades marinas. Por medio del trabajo con cultivos representativos de este grupo taxonómico hemos hecho avances importantes en la fisiología de los organismos marinos que utilizan la materia orgánica y la luz para crecer. Nuestros estudios y los de otros autores nos han llevado al diseño de un modelo que describe la función de los Bacteroidetes en el ambiente marino. Este grupo parece estar adaptado, entre otros, al crecimiento con polisacáridos y péptidos, la utilización de factores de crecimiento a baja concentración, a la adhesión sobre las partículas y a la obtención de energía a partir de la luz. Con esta información creemos necesario que nuestro siguiente paso será la de estudiar las interacciones y las adaptaciones de los Bacteroidetes de los océanos. Nos centramos en la expresión de genes que son característicos de la función de los Bacteroidetes en el ambiente marino. El tipo de interacciones entre grupos taxonómicos dentro de los Bacteroidetes y otros componentes del bacterioplancton serán también objeto de estudio. Para esto último nuestro objetivo será el de identificar los genes o los grupos de genes contiguos que favorecen esta interacción.

The oceans constitute the largest ecosystem on Earth and yet one of the least known. The activities of marine microorganism drive the biogeochemical cycles and regulate climate. In addition, human beings have a large impact on the oceans while depend to a large extent on its resources. In previous projects we have made use of the last nucleic acid sequencing technologies to describe the bacterioplankton of the oceans. We have focused on the Bacteroidetes since it is one of the main components of the marine communities. With representative cultures we have made progress towards the understanding of the adaptations of this taxonomic group to the conditions in the ocean. In particular, we have studied the effect that light has on the marine Bacteroidetes while they grow on organic matter. Based on the information we have gathered and those by other research groups we have come up with a general model organism adapted to the adhesion of particles, to the degradation of polysaccharides or peptides for growth and uptake of growth factors at low concentration. We believe that our next step is to make use of this information to answer some key questions about the role of Bacteroidetes in the marine environment. We plan to study the interactions of members of the Bacteroidetes phylum among themselves and with members positioned on other branches of the phylogenetic tree. Our objective is to identify genes and gene clusters that favor such interactions.

Investigador/a de la Universidad de La Laguna